ในตอนท้ายของ สัตว์มหัศจรรย์และถิ่นที่อยู่ ภาค 1 เกลเลิร์ต กรินเดลวัลด์ พ่อมดศาสตร์มืด ผู้ยิ่งใหญ่ถูกจับกุมตัวได้ในนิวยอร์กด้วยความช่วยเหลือของนิวท์ สคามันเดอร์ ทว่าเขาหาทางหลบหนีได้สำเร็จและเริ่มต้นรวบรวมพวกพ้องเพื่อบรรลุปณิธานอันชั่วร้ายในการทำให้พ่อมดเลือดบริสุทธิ์ได้ปกครองสิ่งมีชีวิตที่ไร้เวทมนตร์ทั้งหมด
เพื่อขัดขวางแผนการของกรินเดลวัลด์ อัลบัส ดัมเบิลดอร์จึงขอความช่วยเหลือจากนิวท์ ศิษย์เก่า ที่ตอบตกลงช่วยอีกครั้งโดยไม่รู้เลยว่ามีอันตรายรออยู่เบื้องหน้า เส้นแบ่งระหว่างความรักกับภักดีถูกขีดขึ้น แม้ท่ามกลางเพื่อนแท้ที่สุดและครอบครัว ในโลกเวทมนตร์ที่แตกแยกมากขึ้นเรื่อย ๆ